Organi Asocijacije su Skupština, Upravni odbor i Nadzorni odbor.
Skupštinu čine svi članovi, a sastaje se redovno jednom godišnje. Punopravno radi i odlučuje ako prisustvuje najmanje petina članova. Odluke i zaključci se donose većinom prisutnih članova, a odluke o izmenama i dopunama Statuta, statusnim promenama i prestanku rada mogu doneti 2/3 prisutnih članova. Sednicu Skupštine saziva predsednik Upavnog odbora, pisanim obaveštenjem. Sednicom predsedava član koji se bira javnim glasanjem na početku sednice.
Predsednik Skupštine se bira većinom glasova; zastupa Asocijaciju u pravnom prometu, a istovremeno vrši funkciju predsednika Upravnog odbora i rukovodi njegovim radom.
Upravni odbor je izvršni organ Asocijacijei ima sedam članova koje bira i opoziva Skupština. Mandat članova traje tri godine, a član UO se može birati najviše u dva uzastopna mandata. Upravni odbor iz redova svojih članova bira zamenika predsednika, koji zastupa Asocijaciju u odsustvu predsednika.
Nadzorni odbor kontroliše rad i poslovanje Asocijacije, ima tri člana koje bira Skupština na mandate od tri godine.
Komisije (za zakonodavstvo; za međunarodnu saradnju; za unapređenje struke; za informatiku; za promociju i marketing) pomažu u radu Upravnom odboru. Predsednika i članove komisija bira Upravni odbor.
RUKOVODSTVO APPS
Predsednik Asocijacije prostornih planera Srbije
msr Dušan RISTIĆ, dipl. pr. planer
Prirodno-matematički fakultet Univerziteta u Prištini sa privremenim sedištem u Kosovskoj Mitrovici
Zamenica predsednika Asocijacije prostornih planera Srbije
prof. dr Marija R. JEFTIĆ, dipl. pr. planer
Univerzitet u Beogradu – Geografski fakultet, Beograd
Članovi upravnog odbora Asocijacije prostornih planera Srbije
1. dr Uroš RADOSAVLjEVIĆ, dipl. inž. arh
Univerzitet u Beogradu – Arhitektonski fakultet, Beograd
2. dr Nikola KRUNIĆ, dipl. pr. planer
Institut za arhitekturu i urbanizam Srbije
3. Mario MILIČEVIĆ, dipl. pr. planer
GDi Solutions, Beograd
4. Miloš PAJAGIĆ, dipl. pr. planer
Ministarstvo odbrane
5. Ana ĐORĐEVIĆ, dipl. pr. planer
Koridori Srbije
Nadzorni odbor Asocijacije prostornih planera Srbije
1. dr Branko PROTIĆ, dipl. pr. planer
Univerzitet u Beogradu – Geografski fakultet, Beograd
2. dr Dejan S. ĐORĐEVIĆ, dipl. pr. planer
Agencija za prostorno planiranje i urbanizam Republike Srbije, Beograd
3. prof. dr Bogdan LUKIĆ
profesor u penziji, Univerzitet u Beogradu – Geografski fakultet, Beograd
Komisija za zakonodavstvo
prof. dr Velimir ŠEĆEROV, dipl. pr. planer, predsednik
Univerzitet u Beogradu – Geografski fakultet, Beograd
Komisija za međunarodnu saradnju
mr Marko IVANIŠEVIĆ, dipl. pr. planer, predsednik
Univerzitet u Banjoj Luci – Prirodno-matematički fakultet, Banja Luka
Komisija za unapređenje struke
mr Miroslav MARIĆ, dipl. pr. planer, predsednik
Institut za puteve, Beograd
Komisija za informatiku
msr Vladimir POPOVIĆ, dipl. pr. planer, predsednik
Univerzitet u Beogradu – Geografski fakultet, Beograd
Komisija za marketing i propagandu
Milena Ivanović, mast. inž. arh., predsednik